南口现在没有通地铁，不过南口地区目前有两个地铁站的工程正在建设中——昌平线南延和13号线延长线。 这两条线路是北京轨道交通二期规划中的项目，其中昌平线南延由西二旗开始向南到北清路并设北安河站；而13号线延长线则是由回龙观东站出发经东小营、天通苑南站最终到达燕园。
根据2015年8月北京市规划局发布的《北京地铁三期建设规划 (2017-2019)》环评报告，这两项工程有望于2017年至2019年间开工，建成后将极大方便南口的出行。 另外，在2014年底开通的京张高铁上也将建设一个高铁站——清河站。这座站距南口只有三站地左右，乘客未来可乘高铁直达首都核心区。
除轨道交通外，从南口出城还有高速公路和市区快速路可选。G6京藏高速和S32机场高速均可在一定程度上疏解交通。
隋云若优质答主近日，北京市轨道交通第二期建设规划正式启动环评公示工作，公示中的轨道交通二期建设规划内容显示，昌平区将开建19号线支线、17号线支线、市郊铁路东北环线、有轨电车昌平线等四条轨道线路，涉及南口、昌平城区、沙河高教园区、未来科学城等重点功能区。
具体线路走向将通过环评进一步征求沿线居民意见。公示期至11月19日，市民可通过信件、邮件等方式递交意见。
19号线支线：串联未来科学城、回龙观
19号线支线北起昌平区未来科学城，通过马连洼、牡丹园等换乘枢纽串联13、10、4、5、12、16等轨道交通线路，向南至海淀区玉渊潭。
线路全长29公里，设站15座，与19号线贯通运营，共用大屯路东车辆段。作为城市纵线，该线路主要为未来科学城、回龙观等重点功能区提供对外交通服务，实现多层次网络融合，进一步缓解南北交通压力。
17号线支线：直达昌平老城区与南口
17号线支线北起昌平区南口站，经回龙观、天通苑最终至望京西站，全长22.1公里。设站8座，利用亦庄线旧宫车辆段，设计时速为100公里每小时。
作为城市横线，17号线支线主要服务昌平老城区与南口地区，串联回龙观、天通苑、朝阳区崔各庄等大型居住区，直达城市就业中心区，实现居住组团与就业中心“一横一线”功能融合。
市郊铁路东北环线：缓解北部回程拥堵
市郊铁路东北环线利用既有铁路资源进行提升改造，线路全长61.1公里，新建5座车站，改造既有车站4座，新建清河铁路枢纽中心。该线路主要服务北部地区中关村科学城、未来科学城、怀柔科学城、中关村朝阳园和顺义国展、天竺等重点功能区，将改善北部地区回程交通拥堵问题，实现中心城区与多个组团中心“一环多心”功能融合。
有轨电车昌平线：串联多个居住组团
在有轨电车建设方面，规划将建设有轨电车昌平线。该线路为东西横线，串联昌平区多个居住组团及重点功能区，全长24.6公里，设计时速为70公里每小时。
同时，昌平区还拟将既有南邵线改造为城市轨道交通17号线支线、南延至通州榆林庄车辆段；将既有怀密线利用北京北站地下直径线提升运输能力；将昌平区的有轨电车昌平线向西延伸至东小口，与13号线立水桥站换乘。
二期建设规划在支持城市空间布局有序调整的基础上，将实现对城市副中心、多点及特色小城镇的重点保障，支撑中心城区功能有序疏解。规划通过11条线路、258.9公里线网覆盖11个重点功能区及13个外围客运枢纽，涉及北京城市新总规确定的多个重点功能区。
